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广东高效完成病毒全基因组测序

时间:2020-02-16 10:21:39  来源:  作者:  浏览量:

 广东高效完成病毒全基因组测序

 

  随着越来越多的科研成果被披露,大众对新冠肺炎病毒的认识逐渐加深,这其中少不了科研攻关团队的功劳。近日,广东省疾控中心首席专家柯昌文和微检所所长武婕接受采访时透露,早在1月中旬广东就从首例确诊者的样本中检测核酸阳性并完成全基因组测序,工作非常高效。

 

  多年工作经验助力“广东速度”

 

  记者:广东的首株新冠肺炎病毒是如何分离培养出来的?

 

  武婕:实际上,在广东首例确诊者样本确诊阳性后,省疾控中心马上开展全基因组测序才能上送国家进行复核检测。病人样本中的病毒载量非常小,想直接对原始标本中的病毒进行全基因组测序,其难度非常高。但我们做到了,这是除湖北省外的全国首例。

 

  要开展更进一步的研究,就必须要分离出病毒,但新冠病毒的分离培养活动需要向国家申请相关资质,花了近1周的时间获得资质后,我们迅速在三级生物安全实验室中开展实验。

 

  病毒需要在合适的传代细胞中进行培养。这是个全新的病毒,我们只能自己摸索,同时准备了几种不同的细胞系。最终,我们团队凭着多年的工作经验,在vero-E6传代细胞中成功培养出病毒株。

 

  记者:大众很好奇,三级生物安全实验室是怎样的?

 

  柯昌文:我们的三级生物安全实验室有300多平方米,整个实验室完全密封,室内处于负压状态,内部的气体不会泄露到外部。

 

  实验室分3个核心区,每个核心区可以独立开展研究活动。核心区与核心区之间设有缓冲区,杜绝交叉污染。

 

  记者:病毒株有什么作用?需要每天观测吗?

 

  柯昌文:我们每天都会进实验室,因为病毒是在活细胞中培养的,必须每天观察细胞状态,通过观察细胞病变,确定是否有病毒增殖,还可以做一些病毒浓度测定等。

 

  分离培养病毒的目的是可以更详细了解病毒特征,也为疫苗研制和抗体测定提供资源。

 

  除了样本复核,还经常开展应急检测

 

  记者:听起来,实验人员每天都待在实验室里。

 

  柯昌文:我们还会对农贸市场进行采样检测,时刻关注是否存在阳性样本。这对及时调整防控策略非常重要。

 

  武婕:实验室人员到现场采样是工作常态。除了对地市送上来的样本进行核酸复核外,我们经常开展应急检测。我们有同事就在实验室连续工作了36个小时,这些都是工作的常态。

 

  记者:实验室工作和现场工作,哪个更危险?

 

  武婕:都很危险。到现场采样,面对的是未知的环境和感染者,可能有各种各样的突发事件。

 

  而在实验室中,病毒浓度比外界高很多。一个病例可能只携带几千个、几万个病毒,但是用于培养病毒的细胞里,病毒量可能达到百万级、千万级。而且在P3实验室作业的话需要穿戴厚重的防护服,经过严密的消毒才能进入。因此工作人员往往连续工作五六个小时,无法喝水、吃饭,做完实验时防护服内都湿透了。

 

  记者:在如此高危的环境中工作,心里有压力吗?

 

  武婕:说没有就是骗人的。有一次同时来了几百份样本,处理量非常大,因为都要赶着时间做检测,年轻的同事一下子就急哭了。我只能安慰她,现在是特殊时期,我们可以哭,但哭过了还得接着干活。

 

  为提高检测准确度,坚持用人工提取核酸

 

  记者:现在的检测是怎么做的呢?

 

  武婕:省疾控承担的是一些重点样本的检验任务,要求的是准确性。我们一直采用人工提取核酸。这样的流程很花时间,工作量也很大,但可以提高检测的准确度,我们一直坚持这种方法。

 

  记者:针对新型冠状病毒的科技攻关和检验工作,省内不同机构是如何分工的?

 

  柯昌文:省疾控中心与各市、区级疾控中心、部分医院开展密切的合作,包括一些第三方医学检验机构也参与其中。

 

  省疾控中心可以通过医院获取临床病例标本,做核酸检测,分离病毒;第三方医疗检验机构可以做一些基因测序的工作,可以及时掌握病毒变异的特点。

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